Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: CDH15

Cadherin 15

Proudhon et al, Mol. Cell 47: 909–920, 2012

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Cdh15 Mca, Mcad, Cdh14, AI323380  8 71.99 cM  Imprinted Paternal
Homo sapiens CDH15 CDH3, CDHM, MCAD, MRD3, CDH14  16q24.3  Not Imprinted Biallelic
1      cccgcgcacttgcgctgtcactcagcctggacgcgcttcttcgggtcgcgggtgcactcc     60
       ............................................................
61     ggcccggctcccgcctcggccccgATGGACGCCGCGTTCCTCCTCGTCCTCGGGCTGTTG    120
       ........................M--D--A--A--F--L--L--V--L--G--L--L--
121    GCCCAGAGCCTCTGCCTGTCTTTGGGGGTTCCTGGATGGAGGAGGCCCACCACCCTGTAC    180
       A--Q--S--L--C--L--S--L--G--V--P--G--W--R--R--P--T--T--L--Y--
181    CCCTGGCGCCGGGCGCCTGCCCTGAGCCGCGTGCGGAGGGCCTGGGTCATCCCCCCGATC    240
       P--W--R--R--A--P--A--L--S--R--V--R--R--A--W--V--I--P--P--I--
241    AGCGTATCCGAGAACCACAAGCGTCTCCCCTACCCCCTGGTTCAGATCAAGTCGGACAAG    300
       S--V--S--E--N--H--K--R--L--P--Y--P--L--V--Q--I--K--S--D--K--
301    CAGCAGCTGGGCAGCGTCATCTACAGCATCCAGGGACCCGGCGTGGATGAGGAGCCCCGG    360
       Q--Q--L--G--S--V--I--Y--S--I--Q--G--P--G--V--D--E--E--P--R--
361    GGCGTCTTCTCTATCGACAAGTTCACAGGGAAGGTCTTCCTCAATGCCATGCTGGACCGC    420
       G--V--F--S--I--D--K--F--T--G--K--V--F--L--N--A--M--L--D--R--
421    GAGAAGACTGATCGCTTCAGGCTAAGAGCGTTTGCCCTGGACCTGGGAGGATCCACCCTG    480
       E--K--T--D--R--F--R--L--R--A--F--A--L--D--L--G--G--S--T--L--
481    GAGGACCCCACGGACCTGGAGATTGTAGTTGTGGATCAGAATGACAACCGGCCAGCCTTC    540
       E--D--P--T--D--L--E--I--V--V--V--D--Q--N--D--N--R--P--A--F--
541    CTGCAGGAGGCGTTCACTGGCCGCGTGCTGGAGGGTGCAGTCCCAGGCACCTATGTGACC    600
       L--Q--E--A--F--T--G--R--V--L--E--G--A--V--P--G--T--Y--V--T--
601    AGGGCAGAGGCCACAGATGCCGACGACCCCGAGACGGACAACGCAGCGCTGCGGTTCTCC    660
       R--A--E--A--T--D--A--D--D--P--E--T--D--N--A--A--L--R--F--S--
661    ATCCTGCAGCAGGGCAGCCCCGAGCTCTTCAGCATCGACGAGCTCACAGGAGAGATCCGC    720
       I--L--Q--Q--G--S--P--E--L--F--S--I--D--E--L--T--G--E--I--R--
721    ACAGTGCAAGTGGGGCTGGACCGCGAGGTGGTCGCGGTGTACAATCTGACCCTGCAGGTG    780
       T--V--Q--V--G--L--D--R--E--V--V--A--V--Y--N--L--T--L--Q--V--
781    GCGGACATGTCTGGAGACGGCCTCACAGCCACTGCCTCAGCCATCATCACCCTTGATGAC    840
       A--D--M--S--G--D--G--L--T--A--T--A--S--A--I--I--T--L--D--D--
841    ATCAATGACAATGCCCCCGAGTTCACCAGGGATGAGTTCTTCATGGAGGCCATAGAGGCC    900
       I--N--D--N--A--P--E--F--T--R--D--E--F--F--M--E--A--I--E--A--
901    GTCAGCGGAGTGGATGTGGGACGCCTGGAAGTGGAGGACAGGGACCTGCCAGGCTCCCCA    960
       V--S--G--V--D--V--G--R--L--E--V--E--D--R--D--L--P--G--S--P--
961    AACTGGGTGGCCAGGTTCACCATCCTGGAAGGCGACCCCGATGGGCAGTTCACCATCCGC   1020
       N--W--V--A--R--F--T--I--L--E--G--D--P--D--G--Q--F--T--I--R--
1021   ACGGACCCCAAGACCAACGAGGGTGTTCTGTCCATTGTGAAGGCCCTGGACTATGAGAGC   1080
       T--D--P--K--T--N--E--G--V--L--S--I--V--K--A--L--D--Y--E--S--
1081   TGTGAACACTACGAACTCAAAGTGTCGGTGCAGAATGAGGCCCCGCTGCAGGCGGCTGCC   1140
       C--E--H--Y--E--L--K--V--S--V--Q--N--E--A--P--L--Q--A--A--A--
1141   CTTAGGGCTGAGCGGGGCCAGGCCAAGGTCCGCGTGCATGTGCAGGACACCAACGAGCCC   1200
       L--R--A--E--R--G--Q--A--K--V--R--V--H--V--Q--D--T--N--E--P--
1201   CCCGTGTTCCAGGAGAACCCACTTCGGACCAGCCTAGCAGAGGGGGCACCCCCAGGCACT   1260
       P--V--F--Q--E--N--P--L--R--T--S--L--A--E--G--A--P--P--G--T--
1261   CTGGTGGCCACCTTCTCTGCCCGGGACCCTGACACAGAGCAGCTGCAGAGGCTCAGCTAC   1320
       L--V--A--T--F--S--A--R--D--P--D--T--E--Q--L--Q--R--L--S--Y--
1321   TCCAAGGACTACGACCCGGAAGACTGGCTGCAAGTGGACGCAGCCACTGGCCGGATCCAG   1380
       S--K--D--Y--D--P--E--D--W--L--Q--V--D--A--A--T--G--R--I--Q--
1381   ACCCAGCACGTGCTCAGCCCGGCGTCCCCCTTCCTCAAGGGCGGCTGGTACAGAGCCATC   1440
       T--Q--H--V--L--S--P--A--S--P--F--L--K--G--G--W--Y--R--A--I--
1441   GTCCTGGCCCAGGATGACGCCTCCCAGCCCCGCACCGCCACCGGCACCCTGTCCATCGAG   1500
       V--L--A--Q--D--D--A--S--Q--P--R--T--A--T--G--T--L--S--I--E--
1501   ATCCTGGAGGTGAACGACCATGCACCTGTGCTGGCCCCGCCGCCGCCGGGCAGCCTGTGC   1560
       I--L--E--V--N--D--H--A--P--V--L--A--P--P--P--P--G--S--L--C--
1561   AGCGAGCCACACCAAGGCCCAGGCCTCCTCCTGGGCGCCACGGATGAGGACCTGCCCCCC   1620
       S--E--P--H--Q--G--P--G--L--L--L--G--A--T--D--E--D--L--P--P--
1621   CACGGGGCCCCCTTCCACTTCCAGCTGAGCCCCAGGCTCCCAGAGCTCGGCCGGAACTGG   1680
       H--G--A--P--F--H--F--Q--L--S--P--R--L--P--E--L--G--R--N--W--
1681   AGCCTCAGCCAGGTCAACGTGAGCCACGCGCGCCTGCGGCCGCGACACCAGGTCCCCGAA   1740
       S--L--S--Q--V--N--V--S--H--A--R--L--R--P--R--H--Q--V--P--E--
1741   GGCCTGCACCGCCTCAGCCTGCTGCTCCGGGACTCGGGGCAGCCGCCCCAGCAGCGCGAG   1800
       G--L--H--R--L--S--L--L--L--R--D--S--G--Q--P--P--Q--Q--R--E--
1801   CAGCCTCTGAACGTGACCGTGTGCCGCTGCGGCAAGGACGGCGTCTGCCTGCCGGGGGCC   1860
       Q--P--L--N--V--T--V--C--R--C--G--K--D--G--V--C--L--P--G--A--
1861   GCAGCGCTGCTGGCGGGGGGCACAGGCCTCAGCCTGGGCGCACTGGTCATCGTGCTGGCC   1920
       A--A--L--L--A--G--G--T--G--L--S--L--G--A--L--V--I--V--L--A--
1921   AGCGCCCTCCTGCTGCTGGTGCTGGTCCTGCTCGTGGCACTCCGGGCGCGGTTCTGGAAG   1980
       S--A--L--L--L--L--V--L--V--L--L--V--A--L--R--A--R--F--W--K--
1981   CAGTCTCGGGGCAAGGGGCTGCTGCACGGCCCCCAGGACGACCTTCGAGACAATGTCCTC   2040
       Q--S--R--G--K--G--L--L--H--G--P--Q--D--D--L--R--D--N--V--L--
2041   AACTACGATGAGCAAGGAGGCGGGGAGGAGGACCAGGACGCCTACGACATCAGCCAGCTG   2100
       N--Y--D--E--Q--G--G--G--E--E--D--Q--D--A--Y--D--I--S--Q--L--
2101   CGTCACCCGACAGCGCTGAGCCTGCCTCTGGGACCGCCGCCACTTCGCAGAGATGCCCCG   2160
       R--H--P--T--A--L--S--L--P--L--G--P--P--P--L--R--R--D--A--P--
2161   CAGGGCCGCCTGCACCCCCAGCCACCCCGAGTGCTGCCCACCAGCCCCCTGGACATCGCC   2220
       Q--G--R--L--H--P--Q--P--P--R--V--L--P--T--S--P--L--D--I--A--
2221   GACTTCATCAATGATGGCTTGGAGGCTGCAGATAGTGACCCCAGTGTGCCGCCTTACGAC   2280
       D--F--I--N--D--G--L--E--A--A--D--S--D--P--S--V--P--P--Y--D--
2281   ACAGCCCTCATCTATGACTACGAGGGTGACGGCTCGGTGGCGGGGACGCTGAGCTCCATC   2340
       T--A--L--I--Y--D--Y--E--G--D--G--S--V--A--G--T--L--S--S--I--
2341   CTGTCCAGCCAGGGCGATGAGGACCAGGACTACGACTACCTCAGAGACTGGGGGCCCCGC   2400
       L--S--S--Q--G--D--E--D--Q--D--Y--D--Y--L--R--D--W--G--P--R--
2401   TTCGCCCGGCTGGCAGACATGTATGGGCACCCGTGCGGGTTGGAGTACGGGGCCAGATGG   2460
       F--A--R--L--A--D--M--Y--G--H--P--C--G--L--E--Y--G--A--R--W--
2461   GACCACCAGGCCAGGGAGGGTCTTTCTCCTGGGGCACTGCTACCCAGACACAGAGGCCGG   2520
       D--H--Q--A--R--E--G--L--S--P--G--A--L--L--P--R--H--R--G--R--
2521   ACAGCCTGAccctggggcgcaactggacatgccactccccggcctcgtggcagtgatggc   2580
       T--A--***...................................................
2581   ccctgcagaggcagcctgaggtcaccgggcccgacccccctgggcctggggcagcctcct   2640
       ............................................................
2641   tcctgtaggcgagggcccaagtctgggggcagaacctgagtgtggatggggcggccagga   2700
       ............................................................
2701   agaggccccttcctgccggggtgggaagagtttctctccatcggccccatgcgggtcacc   2760
       ............................................................
2761   tccctagtcccacctttgcctcctaccagtgaacctcatctttgtatgaaagacagcaac   2820
       ............................................................
2821   ctcctgggtaaatctgaatgaaaaacgtgctagtctctttcatgca                 2880
       ..............................................