Imprinted Gene Databases

Rattus norvegicus: Sfmbt2

Scm-like with four mbt domains 2

Wang et al., BMC Genomics 12: 204, 2011

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SFMBT2   10p14  Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Sfmbt2 D2Wsu23e, D330030P06Rik  2 6.0 cM  Imprinted Paternal
Bos taurus SFMBT2   13  Not Imprinted Biallelic
Rattus norvegicus Sfmbt2   17q12.3  Imprinted Maternal
1      acagttttatttcctgaggaaaagagatatcggaccgtgctgatccctggatgaattaag     60
       ............................................................
61     ggagctcgaggcatagtcaacagcATGGAGAGACGTTTGCCAGTTTTGAAGATCCGCACC    120
       ........................M--E--R--R--L--P--V--L--K--I--R--T--
121    TCATCCTCCTCTCTGGAAAGGATTACCAGCCCAGAAAATGGGAATGGGAGTCTTGACACA    180
       S--S--S--S--L--E--R--I--T--S--P--E--N--G--N--G--S--L--D--T--
181    GAGGAAGATTCCAGGCAGGAGGAAACTGAGTTCAGCTGGGGAGACTATTTGGATGAGACG    240
       E--E--D--S--R--Q--E--E--T--E--F--S--W--G--D--Y--L--D--E--T--
241    GGTGCCAGAGCGGTACCACACGTGTGCTTCAGACATGTGGAGATCAGCATTCAGAGTAAC    300
       G--A--R--A--V--P--H--V--C--F--R--H--V--E--I--S--I--Q--S--N--
301    TTCCAGCCAGGAATGAAGTTGGAGGTGGCCAACAAGAACCATCCAGACACTTACTGGGTG    360
       F--Q--P--G--M--K--L--E--V--A--N--K--N--H--P--D--T--Y--W--V--
361    GCCACGATCATCACCACCTGTGGACAGCTGCTGCTCCTGCGTTACTGTGGTTATGGGGAG    420
       A--T--I--I--T--T--C--G--Q--L--L--L--L--R--Y--C--G--Y--G--E--
421    GACCGAAGGGCTGACTTCTGGTGTGATGTCATCATAGCAGATCTGCACCCTGTGGGGTGG    480
       D--R--R--A--D--F--W--C--D--V--I--I--A--D--L--H--P--V--G--W--
481    TGTACTCAGAACAACAAGGTGTTGAGGCCCCCGGATGCTATCAAAGAGAAGTATGCCGAC    540
       C--T--Q--N--N--K--V--L--R--P--P--D--A--I--K--E--K--Y--A--D--
541    TGGGAGGAATTCCTCATACATGAATTGACTGGTTCTCGGACAGCACCTGCAAGCCTTCTG    600
       W--E--E--F--L--I--H--E--L--T--G--S--R--T--A--P--A--S--L--L--
601    GAAGAGCTGCAGGACTCTCAGAATCCCTTTCAGTACTGGATAGTTAGTGTGATTGAAAAT    660
       E--E--L--Q--D--S--Q--N--P--F--Q--Y--W--I--V--S--V--I--E--N--
661    GTCGGAGGAAGATTACGCCTTCGCTATGTGGGATTGGAGCACACTGAATCCTATGACCGG    720
       V--G--G--R--L--R--L--R--Y--V--G--L--E--H--T--E--S--Y--D--R--
721    TGGTTATTTTACTTGGATTACAGACTTCGACCAATTGGTTGGTGTCAAGAAAAAAAATAC    780
       W--L--F--Y--L--D--Y--R--L--R--P--I--G--W--C--Q--E--K--K--Y--
781    AGAATGGATCCACCTTCAGAACTTTATTATCTGAAGTTGCCTTTTGAATGGAAATGTGCA    840
       R--M--D--P--P--S--E--L--Y--Y--L--K--L--P--F--E--W--K--C--A--
841    CTAGAAAAAGCCTTGCTTGCCGCTGCAGAGTGTCCCCTTCCAATGGAAGTATTTAAGGAC    900
       L--E--K--A--L--L--A--A--A--E--C--P--L--P--M--E--V--F--K--D--
901    CATGCAGACTTGGGAAGCCATTTCTTTACAGTTGGGATGCGGCTGGAGACATTGCACATC    960
       H--A--D--L--G--S--H--F--F--T--V--G--M--R--L--E--T--L--H--I--
961    AATGATCCCTTTCATATCTATCCTGCAACAGTGACCAAGGTTTTTAACAGTCAGTTTTTC   1020
       N--D--P--F--H--I--Y--P--A--T--V--T--K--V--F--N--S--Q--F--F--
1021   CAAGTGGCCATTGATGACTTAAGAGCCGAGACTAATGGACTCACAATGCTGTGCCACGCA   1080
       Q--V--A--I--D--D--L--R--A--E--T--N--G--L--T--M--L--C--H--A--
1081   GATTCTTTGGGGATTTTGCCAGTACAGTGGTGCCTTAAAAATGGAGTCAACCTCGCTCCT   1140
       D--S--L--G--I--L--P--V--Q--W--C--L--K--N--G--V--N--L--A--P--
1141   CCCAAAGGTTACTCAGGCCAGGATTTTAACTGGGTGGATTATCACAAGCAGCGCGAGGCC   1200
       P--K--G--Y--S--G--Q--D--F--N--W--V--D--Y--H--K--Q--R--E--A--
1201   GAAGGAGCCCCTCCTTACTGCTTCAAAAATACATTTGCTCGGGGCTTTGCAAAGAACATG   1260
       E--G--A--P--P--Y--C--F--K--N--T--F--A--R--G--F--A--K--N--M--
1261   AAGCTTGAAGCTGTGAACCCCAAGAATCCAGGAGAGGTGTGCGTGGCCACTGTGATCAGC   1320
       K--L--E--A--V--N--P--K--N--P--G--E--V--C--V--A--T--V--I--S--
1321   GTGAGAGGGAGTTTGTTATGGCTCCGTTTAGAAGGTGTGGAGACACCGATGCCAGAGATC   1380
       V--R--G--S--L--L--W--L--R--L--E--G--V--E--T--P--M--P--E--I--
1381   ATTGTGGATATAGATTCCATGGACATCTTCCCCGTAGGCTGGTGTGAAGCGAATTCTTAC   1440
       I--V--D--I--D--S--M--D--I--F--P--V--G--W--C--E--A--N--S--Y--
1441   CCTTTGACCACACCATACAAGTCGTCCTCAGGAGCCGCCAATGAGAAGTACTACTGCCCA   1500
       P--L--T--T--P--Y--K--S--S--S--G--A--A--N--E--K--Y--Y--C--P--
1501   CAGCTGTTCGTCAACCACCGGTGTTTCTCAGGCCCGTTCCTGAACAAAGGAAGGATTTCA   1560
       Q--L--F--V--N--H--R--C--F--S--G--P--F--L--N--K--G--R--I--S--
1561   GAACTACCTCAGTCCGTGGGACCTGGCAAGTGCGTGCTGGTGCTTAAAGAGATTCTTACC   1620
       E--L--P--Q--S--V--G--P--G--K--C--V--L--V--L--K--E--I--L--T--
1621   ATGATTACCAATGCAGCCTACAAGCCCGGGAGGGTGTTGAGAGAGTTACAGCTGGTAGAA   1680
       M--I--T--N--A--A--Y--K--P--G--R--V--L--R--E--L--Q--L--V--E--
1681   GATCCAGAGTGGGATTTCCAGGAGGAGGTGCTCAAGGCAAAATACCGAGGCAAAATATAC   1740
       D--P--E--W--D--F--Q--E--E--V--L--K--A--K--Y--R--G--K--I--Y--
1741   AGGGCCGTGGTCAAGATCGTGCGGACAGCAGACCAAGTAACAAGCTTCTGCCAGCAAGTT   1800
       R--A--V--V--K--I--V--R--T--A--D--Q--V--T--S--F--C--Q--Q--V--
1801   TGTGCCAAACTGGAGTGCTGTCCGAACTTATTCAGTCCCCTGCTGATCTCTGAAAACTGC   1860
       C--A--K--L--E--C--C--P--N--L--F--S--P--L--L--I--S--E--N--C--
1861   CCGGAGAATTGTTCCATCCGCACCAAAACCAAATACACCTATTACTATGGGAAAAGGAAG   1920
       P--E--N--C--S--I--R--T--K--T--K--Y--T--Y--Y--Y--G--K--R--K--
1921   AGGATCATTAAACCTCCACTCGGAGAAAGCAACACTGAAAGCGCACCAAAACCCACCAGG   1980
       R--I--I--K--P--P--L--G--E--S--N--T--E--S--A--P--K--P--T--R--
1981   AGAAGGAAACGAAGAAAATCAATCTATGTGCAGAAGAAACGGAAATCCTCTGCGGTGGCC   2040
       R--R--K--R--R--K--S--I--Y--V--Q--K--K--R--K--S--S--A--V--A--
2041   ATGCCAGCGACCTCGGCACAGCACATCCCTCTGCCCCTCAGGAAACTGAAGAGGACGATC   2100
       M--P--A--T--S--A--Q--H--I--P--L--P--L--R--K--L--K--R--T--I--
2101   CAGAGGCCCTGGACACTGCAAGCGAGGAAACTGGTTACGTGGTCCAGAATTACAAGACAC   2160
       Q--R--P--W--T--L--Q--A--R--K--L--V--T--W--S--R--I--T--R--H--
2161   AGCATGTACCAGTAGagatgccctttacccgttcacagagggctatgatcctgaggaaac   2220
       S--M--Y--Q--***.............................................
2221   attcaggggctgtaaagcaccctccagtggaaagggcacggagggtccgctcagtgcact   2280
       ............................................................
2281   ctactgcctcttctaataacagaaacaaggttccacttgtcaggattgagaaatcagagg   2340
       ............................................................
2341   acccaaggcagtcggaggaggagaaactgattcttgagagcaatccgctggagtggtccg   2400
       ............................................................
2401   tcacagatgtggtgcgattcattaagctgactgactgtgcacctttggccaggatctttc   2460
       ............................................................
2461   aagagcaggacatcgatggccaggctctcctcctgctcactctcccaacagtgcaggagt   2520
       ............................................................
2521   gcatggagctgaagctaggacctgcgatcaaattatgccatcagatcgagagagtgaaag   2580
       ............................................................
2581   tggctttctacgcccagtacgccaattag                                  2640
       .............................