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Homo sapiens: APBA1

Amyloid beta precursor protein-binding, family A, member 1

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens APBA1 X11, X11A, MINT1, D9S411E, X11ALPHA  9:71225021-71487041 AS (9q13-q21.1)  Predicted Paternal
1      ggcggcggcggcggcggcggcagctgcggcgggagaagatggtggcgctggaggcagcag     60
       ............................................................
61     cggctggagcggagctttattcccaggcttggcaccagcgctgtcactagcgccgcctgc    120
       ............................................................
121    tcccgcgggcccgcggacccagctgtcaggcaagcccagtggagcaaaatgagagcgcag    180
       ............................................................
181    tgagccgggcccagcttctctcctagccgttccgactcccaccATGAACCACTTGGAGGG    240
       ...........................................M--N--H--L--E--G-
241    GTCTGCGGAGGTGGAGGTGACCGACGAGGCGGCAGGTGGGGAGGTGAACGAGTCGGTGGA    300
       -S--A--E--V--E--V--T--D--E--A--A--G--G--E--V--N--E--S--V--E-
301    GGCCGACCTGGAGCACCCCGAGGTGGAAGAGGAACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGCAGCA    360
       -A--D--L--E--H--P--E--V--E--E--E--Q--Q--Q--P--P--Q--Q--Q--H-
361    CTATGTGGGCCGCCACCAGCGCGGGCGAGCCCTCGAGGACCTCCGCGCCCAGCTCGGCCA    420
       -Y--V--G--R--H--Q--R--G--R--A--L--E--D--L--R--A--Q--L--G--Q-
421    GGAGGAAGAGGAGCGCGGGGAATGCCTGGCGCGCTCAGCCAGCACGGAGAGCGGCTTCCA    480
       -E--E--E--E--R--G--E--C--L--A--R--S--A--S--T--E--S--G--F--H-
481    CAACCACACGGACACCGCCGAGGGCGACGTGATCGCCGCGGCCCGCGACGGCTACGATGC    540
       -N--H--T--D--T--A--E--G--D--V--I--A--A--A--R--D--G--Y--D--A-
541    GGAGCGCGCGCAGGACCCCGAGGACGAGAGCGCCTATGCTGTGCAGTACCGGCCCGAGGC    600
       -E--R--A--Q--D--P--E--D--E--S--A--Y--A--V--Q--Y--R--P--E--A-
601    CGAGGAGTACACGGAGCAGGCAGAGGCCGAGCACGCCGAGGCCACGCACCGCCGCGCGCT    660
       -E--E--Y--T--E--Q--A--E--A--E--H--A--E--A--T--H--R--R--A--L-
661    GCCCAACCACCTGCACTTCCACTCGCTGGAGCACGAGGAAGCCATGAATGCGGCCTACTC    720
       -P--N--H--L--H--F--H--S--L--E--H--E--E--A--M--N--A--A--Y--S-
721    AGGCTACGTCTACACGCACCGGCTCTTCCACCGCGGTGAGGACGAGCCCTACTCCGAGCC    780
       -G--Y--V--Y--T--H--R--L--F--H--R--G--E--D--E--P--Y--S--E--P-
781    CTATGCCGACTACGGCGGCCTCCAGGAGCACGTGTACGAGGAGATAGGGGACGCGCCCGA    840
       -Y--A--D--Y--G--G--L--Q--E--H--V--Y--E--E--I--G--D--A--P--E-
841    GCTGGACGCACGCGACGGCCTGCGGCTCTACGAGCAGGAGCGCGACGAGGCGGCCGCGTA    900
       -L--D--A--R--D--G--L--R--L--Y--E--Q--E--R--D--E--A--A--A--Y-
901    CCGCCAGGAGGCCCTGGGCGCGCGGCTGCACCATTACGACGAGCGCTCCGACGGCGAGTC    960
       -R--Q--E--A--L--G--A--R--L--H--H--Y--D--E--R--S--D--G--E--S-
961    CGACAGCCCCGAGAAGGAGGCCGAGTTCGCGCCCTACCCGCGCATGGACAGCTACGAGCA   1020
       -D--S--P--E--K--E--A--E--F--A--P--Y--P--R--M--D--S--Y--E--Q-
1021   GGAGGAGGACATCGACCAGATAGTGGCCGAGGTGAAGCAGAGCATGAGCTCGCAGAGCCT   1080
       -E--E--D--I--D--Q--I--V--A--E--V--K--Q--S--M--S--S--Q--S--L-
1081   CGACAAGGCAGCCGAGGACATGCCTGAGGCCGAGCAGGACCTGGAGCGTCCCCCTACCCC   1140
       -D--K--A--A--E--D--M--P--E--A--E--Q--D--L--E--R--P--P--T--P-
1141   GGCCGGGGGTCGCCCCGACAGCCCCGGGCTGCAGGCGCCGGCGGGGCAGCAGCGGGCGGT   1200
       -A--G--G--R--P--D--S--P--G--L--Q--A--P--A--G--Q--Q--R--A--V-
1201   GGGCCCCGCGGGCGGCGGCGAGGCGGGGCAGCGGTACAGCAAGGAGAAGCGCGATGCCAT   1260
       -G--P--A--G--G--G--E--A--G--Q--R--Y--S--K--E--K--R--D--A--I-
1261   CTCGCTGGCCATCAAGGACATCAAGGAGGCCATCGAGGAGGTGAAAACCAGGACCATCCG   1320
       -S--L--A--I--K--D--I--K--E--A--I--E--E--V--K--T--R--T--I--R-
1321   TTCGCCTTACACCCCCGACGAGCCCAAAGAGCCCATCTGGGTCATGCGCCAGGACATTAG   1380
       -S--P--Y--T--P--D--E--P--K--E--P--I--W--V--M--R--Q--D--I--S-
1381   CCCCACCAGGGACTGTGACGACCAGAGGCCGATGGACGGAGATTCTCCGTCTCCTGGCAG   1440
       -P--T--R--D--C--D--D--Q--R--P--M--D--G--D--S--P--S--P--G--S-
1441   CTCCTCCCCCTTGGGTGCAGAGTCATCAAGCACATCTCTTCACCCCAGTGACCCTGTGGA   1500
       -S--S--P--L--G--A--E--S--S--S--T--S--L--H--P--S--D--P--V--E-
1501   AGCGTCCACTAATAAAGAGTCAAGAAAAAGCTTGGCTTCATTCCCAACCTACGTTGAAGT   1560
       -A--S--T--N--K--E--S--R--K--S--L--A--S--F--P--T--Y--V--E--V-
1561   TCCGGGACCCTGCGACCCCGAAGACTTGATCGATGGAATCATTTTTGCCGCCAATTACCT   1620
       -P--G--P--C--D--P--E--D--L--I--D--G--I--I--F--A--A--N--Y--L-
1621   TGGCTCCACTCAGCTGCTCTCAGACAAAACTCCTTCCAAAAACGTGCGCATGATGCAGGC   1680
       -G--S--T--Q--L--L--S--D--K--T--P--S--K--N--V--R--M--M--Q--A-
1681   CCAGGAAGCCGTAAGCAGGATCAAGATGGCCCAGAAATTAGCCAAAAGCAGGAAGAAGGC   1740
       -Q--E--A--V--S--R--I--K--M--A--Q--K--L--A--K--S--R--K--K--A-
1741   TCCTGAAGGCGAATCTCAGCCAATGACTGAAGTGGATCTCTTCATTTCTACCCAGAGAAT   1800
       -P--E--G--E--S--Q--P--M--T--E--V--D--L--F--I--S--T--Q--R--I-
1801   CAAAGTGCTGAACGCCGACACACAGGAGACAATGATGGACCACCCTCTGAGGACCATTTC   1860
       -K--V--L--N--A--D--T--Q--E--T--M--M--D--H--P--L--R--T--I--S-
1861   CTACATTGCGGACATTGGGAACATCGTTGTGCTGATGGCCCGCCGGCGGATGCCTCGCTC   1920
       -Y--I--A--D--I--G--N--I--V--V--L--M--A--R--R--R--M--P--R--S-
1921   CAACTCCCAGGAGAACGTGGAAGCGTCCCACCCATCCCAGGATGGGAAAAGGCAGTACAA   1980
       -N--S--Q--E--N--V--E--A--S--H--P--S--Q--D--G--K--R--Q--Y--K-
1981   GATGATCTGCCACGTCTTCGAGTCTGAGGATGCTCAGCTGATTGCACAGTCCATCGGACA   2040
       -M--I--C--H--V--F--E--S--E--D--A--Q--L--I--A--Q--S--I--G--Q-
2041   GGCATTTAGCGTGGCATACCAGGAATTCCTCAGGGCCAATGGGATTAACCCCGAAGATCT   2100
       -A--F--S--V--A--Y--Q--E--F--L--R--A--N--G--I--N--P--E--D--L-
2101   CAGCCAGAAGGAGTATAGTGACCTGCTCAATACCCAGGACATGTACAACGATGACCTGAT   2160
       -S--Q--K--E--Y--S--D--L--L--N--T--Q--D--M--Y--N--D--D--L--I-
2161   CCACTTCTCCAAGTCGGAAAACTGTAAAGATGTTTTCATAGAGAAGCAGAAAGGAGAAAT   2220
       -H--F--S--K--S--E--N--C--K--D--V--F--I--E--K--Q--K--G--E--I-
2221   CCTAGGTGTGGTGATTGTGGAGTCTGGCTGGGGATCCATCCTCCCCACCGTGATCATTGC   2280
       -L--G--V--V--I--V--E--S--G--W--G--S--I--L--P--T--V--I--I--A-
2281   CAACATGATGCATGGTGGCCCTGCGGAGAAATCTGGGAAGCTGAATATCGGTGACCAGAT   2340
       -N--M--M--H--G--G--P--A--E--K--S--G--K--L--N--I--G--D--Q--I-
2341   CATGTCCATTAATGGCACCAGCCTGGTGGGCCTGCCTCTGTCCACCTGCCAGAGCATTAT   2400
       -M--S--I--N--G--T--S--L--V--G--L--P--L--S--T--C--Q--S--I--I-
2401   TAAGGGCTTAAAGAATCAGTCCCGAGTCAAGCTGAATATCGTGAGATGTCCTCCGGTGAC   2460
       -K--G--L--K--N--Q--S--R--V--K--L--N--I--V--R--C--P--P--V--T-
2461   CACCGTGTTAATCAGAAGACCAGACCTTCGCTACCAGCTCGGTTTCAGCGTCCAGAATGG   2520
       -T--V--L--I--R--R--P--D--L--R--Y--Q--L--G--F--S--V--Q--N--G-
2521   AATTATCTGCAGCCTCATGCGAGGGGGAATAGCTGAGAGAGGAGGCGTCCGTGTGGGGCA   2580
       -I--I--C--S--L--M--R--G--G--I--A--E--R--G--G--V--R--V--G--H-
2581   CCGGATCATTGAAATCAATGGACAGAGCGTCGTGGCCACCCCCCACGAGAAGATCGTCCA   2640
       -R--I--I--E--I--N--G--Q--S--V--V--A--T--P--H--E--K--I--V--H-
2641   CATTCTCTCCAATGCTGTTGGGGAGATTCATATGAAGACAATGCCAGCCGCGATGTACAG   2700
       -I--L--S--N--A--V--G--E--I--H--M--K--T--M--P--A--A--M--Y--R-
2701   GCTGCTGACGGCCCAGGAGCAGCCTGTTTACATCTGAccgcggccacacgcggtggcatg   2760
       -L--L--T--A--Q--E--Q--P--V--Y--I--***.......................
2761   catggaggactctcctcttcgtggttgtgtttctcgtgctgcatccctgtgtccactgag   2820
       ............................................................
2821   actttcccctctcgcgcccagcatttggttttacacaggaagagaagaatccacaaggac   2880
       ............................................................
2881   ctctttactctctccgatttgcttttttttttttttttttttcaataccagggaagtttc   2940
       ............................................................
2941   gtatgcactcccttgaggatggagagcagccagcacccacctggtactgacccaggacca   3000
       ............................................................
3001   tcctggagggctttctgggtgtgtccagggggtgggctgtcactgcttgagggagaatcc   3060
       ............................................................
3061   tcccttcccaggaggtgcagacttcttaaaaggagctcgcggggcagcaaagcagctgat   3120
       ............................................................
3121   tcagcagtgcctaaaacccagttgctgatccctgctctctgagtttatctgtgggaatgt   3180
       ............................................................
3181   ggtagtacccagggccagcccacgtcattaaggttatgcactgcctgccatgtagttggg   3240
       ............................................................
3241   gcaccatacattatttcttcccagaatctctgagccaaccttaaacctcttctattgcta   3300
       ............................................................
3301   gttctaatttcaacgtatgtgtgttttctaatacgagccttctcaccccaggataaaagg   3360
       ............................................................
3361   ggaaataactgccttgggcaaggacaccatagtgtcacagagagcttggcaattcatggg   3420
       ............................................................
3421   gcatctgaagctttaccaggttgtcctcaagttatcaaccattagataaacacaggcagg   3480
       ............................................................
3481   tactgtctgcttctctctctctcacacacacacacacacacacagtcccatttgcatatc   3540
       ............................................................
3541   acccttccctgctcccaccaccagtgagacaagctgaagattaggcacacagatcccctg   3600
       ............................................................
3601   gaaacccacctctctggaaggccccttccctggcaggtggccaggcaggcgggggctgct   3660
       ............................................................
3661   cagcctcatcctgagagacctgccctctctgcgctgaggcccagcccctccagcaccact   3720
       ............................................................
3721   ttggcttaaagcatcctcctcctggactcccctccctgccgaacacacatcccaggag     3780
       ..........................................................