Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Zcchc13

Zinc finger, CCHC domain containing 13

Kobayashi et al., PLoS One 8: e71222, 2013

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Zcchc13 Cnbp2, 4930513O09Rik  X 46.26 cM  Imprinted Maternal
1      tttccatctaagccatcctaggcaggtagcctcggggcccgtggcagtggggtgtgggcc     60
       ............................................................
61     tgctcaccggaagatctcaccgtacccATGAGCAGTAAAAGTTGCTTCAAGTGTGGACAC    120
       ...........................M--S--S--K--S--C--F--K--C--G--H--
121    TCTGGCCACTGGGCCCGGGAGTGTCCTAAGGGAGGAACCCGAGGGCGAACAGCAAGAGGT    180
       S--G--H--W--A--R--E--C--P--K--G--G--T--R--G--R--T--A--R--G--
181    CGTACCAGAGGTCCCCAGTGCAGCACCGCCAACCAGTCCGATGTTTGTTATCGCTGTGGT    240
       R--T--R--G--P--Q--C--S--T--A--N--Q--S--D--V--C--Y--R--C--G--
241    GAAACTGGTCACTACGCCAAGGACTGTGATCTTCTCCAGGATACCTGCTACAACTGCGGG    300
       E--T--G--H--Y--A--K--D--C--D--L--L--Q--D--T--C--Y--N--C--G--
301    AGAAGAGGACACATAGCTAAGGACTGTACCCAGGCTAAACGAGAGAGGGAGCAGTGCTGT    360
       R--R--G--H--I--A--K--D--C--T--Q--A--K--R--E--R--E--Q--C--C--
361    TACATCTGCAGTCAGCCTGGTCATCTGGCTCGGGACTGCAACCGGCAAGAAGAACAGAAA    420
       Y--I--C--S--Q--P--G--H--L--A--R--D--C--N--R--Q--E--E--Q--K--
421    TGCTACACTTGTGGTGAATTTGGGCACATCCAGAAAGATTGTACCCAAATTAAGTGCTAC    480
       C--Y--T--C--G--E--F--G--H--I--Q--K--D--C--T--Q--I--K--C--Y--
481    AGATGTGGTGAGAATGGCCACATGGCGGTGAACTGCAGCAAGACGAGCGAAGTCAGCTGC    540
       R--C--G--E--N--G--H--M--A--V--N--C--S--K--T--S--E--V--S--C--
541    TACCGCTGTGGAGAGTCTGGACATCTGGCTCGGGAATGCCCCATTGAGGCTACCGCTTAG    600
       Y--R--C--G--E--S--G--H--L--A--R--E--C--P--I--E--A--T--A--***
601    taacccccttaaacgccatcctttactaagtacgctgtttctaacatttctttgctaatc    660
       ............................................................
661    aaaaacgtgatagatggaagctactcctataccattataattatcatcttaaagcaagaa    720
       ............................................................
721    aagactgggggggaaacatgtcaaaaatgttataatcaatatgctatttggttgccatga    780
       ............................................................
781    ggaagttcagatagggcacagccatttttgaattggacactagtggatcctttgagtacg    840
       ............................................................
841    gttcgttttgacacactaaattagaaattgatagtgaaaaattacagcaagcttggaaca    900
       ............................................................
901    tcgtctttgaatttactaacaaatactatatatgtatgtcagatagagataaactgcttt    960
       ............................................................
961    gaagcgagagacaactgactaaaataagaagagaaactacttccttggtggtgggggcaa   1020
       ............................................................
1021   gaacattttgaggaagtaacatttcttcagagacttttagagcaaataaaagtgtttct    1080
       ...........................................................