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Homo sapiens: HOXC9

Homeobox C9

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HOXC9 HOX3, HOX3B  12q13.3  Predicted Maternal
1      tggaaaaataattacctgacttgattgttctgtgagcagataaaaagtacatatacagtt     60
       ............................................................
61     catacaataatcttatgtatgtaaaaccccgttacgATGTCGGCGACGGGGCCCATCAGT    120
       ....................................M--S--A--T--G--P--I--S--
121    AACTATTACGTGGACTCGCTCATCTCTCACGACAATGAAGACCTCCTAGCGTCCAGGTTT    180
       N--Y--Y--V--D--S--L--I--S--H--D--N--E--D--L--L--A--S--R--F--
181    CCGGCCACCGGGGCTCATCCCGCCGCCGCCAGACCCAGCGGTTTGGTGCCGGACTGTAGC    240
       P--A--T--G--A--H--P--A--A--A--R--P--S--G--L--V--P--D--C--S--
241    GATTTTCCGTCCTGTAGCTTCGCGCCCAAGCCGGCAGTGTTCAGCACGTCGTGGGCGCCC    300
       D--F--P--S--C--S--F--A--P--K--P--A--V--F--S--T--S--W--A--P--
301    GTGCCCTCTCAGTCGTCCGTGGTATATCACCCGTACGGCCCCCAGCCCCACCTCGGCGCC    360
       V--P--S--Q--S--S--V--V--Y--H--P--Y--G--P--Q--P--H--L--G--A--
361    GACACGCGCTACATGCGGACTTGGCTCGAGCCGCTGTCCGGCGCCGTCTCCTTCCCCAGC    420
       D--T--R--Y--M--R--T--W--L--E--P--L--S--G--A--V--S--F--P--S--
421    TTCCCGGCCGGGGGCCGTCACTACGCCCTCAAGCCGGACGCCTACCCCGGGCGCCGCGCG    480
       F--P--A--G--G--R--H--Y--A--L--K--P--D--A--Y--P--G--R--R--A--
481    GACTGCGGCCCAGGGGAGGGCCGCAGCTACCCGGACTACATGTACGGCTCGCCCGGGGAG    540
       D--C--G--P--G--E--G--R--S--Y--P--D--Y--M--Y--G--S--P--G--E--
541    CTGCGCGACCGCGCCCCGCAGACACTGCCCTCGCCCGAGGCGGACGCGCTCGCCGGCAGC    600
       L--R--D--R--A--P--Q--T--L--P--S--P--E--A--D--A--L--A--G--S--
601    AAGCACAAAGAGGAGAAGGCCGACCTGGACCCCAGCAACCCCGTGGCCAACTGGATTCAC    660
       K--H--K--E--E--K--A--D--L--D--P--S--N--P--V--A--N--W--I--H--
661    GCCCGCTCCACGAGGAAGAAGCGCTGCCCCTACACCAAGTACCAGACGCTGGAACTGGAG    720
       A--R--S--T--R--K--K--R--C--P--Y--T--K--Y--Q--T--L--E--L--E--
721    AAGGAGTTTCTCTTCAATATGTATTTAACCAGGGACCGTCGGTATGAGGTGGCCCGGGTT    780
       K--E--F--L--F--N--M--Y--L--T--R--D--R--R--Y--E--V--A--R--V--
781    CTCAATCTCACCGAGCGGCAGGTCAAAATCTGGTTTCAGAATCGAAGGATGAAGATGAAA    840
       L--N--L--T--E--R--Q--V--K--I--W--F--Q--N--R--R--M--K--M--K--
841    AAGATGAATAAAGAGAAAACCGACAAGGAGCAGTCCTAAaccctacccagcctgctgcct    900
       K--M--N--K--E--K--T--D--K--E--Q--S--***.....................
901    cagcacagccaagggaaaaacaaaaaccccacaaaataccccaacacaggcgggggagag    960
       ............................................................
961    acgaaaaagaaaaggaaagagcaagatagacaaaagccaatcagcttaaaaagaaaaaca   1020
       ............................................................
1021   aggaaggggaaaagaaaactcttgcgatttgggagggttcagtgttgagatattggtgtt   1080
       ............................................................
1081   ttagagttagttctacccagcgaggaggaggcggggagagaaactgcgttctctttcccc   1140
       ............................................................
1141   agcgcaaccgaaataaatgacacatacaaatgtgatttttttcctcctttcttcagagaa   1200
       ............................................................
1201   gccagtacttgaatcgctatatttctatttttttttccctgtatcgtatttggtccaggt   1260
       ............................................................
1261   catccctccccgggcctggggcgctctgcgtgcagattttgtacaaaaaaaaaaaagaca   1320
       ............................................................
1321   cacacacatacatgataatgattcccagcccaggagctgaggggtgagggctggggacca   1380
       ............................................................
1381   tgccgcgggctaggtcgggcccgtgcaggccggcgccttgggctgtacatagtgttccct   1440
       ............................................................
1441   ctcatccccagggttcgtccccagcgtccgtcctgtaacgtgcttctgtttgttatggta   1500
       ............................................................
1501   gaacagccctgtgttaatatattgaagtcacttaaccagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa   1560
       ............................................................
1561   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa   1620
       ............................................................
1621   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                           1680
       ....................