Imprinted Gene Databases

Imprinted Genes: by Imprinting Status

Below are listings of genes by imprinting status, sorted by name. Gene information has been gathered from NCBI, and some genes lack chromosomal coordinates; these are designated with ---. To change status, select the appropriate tab. To view more information about a gene, click on its name. If there is a gene missing that you feel should be included in the catalog, please contact us.

Only display genes from species:
Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens ABCC9 SUR2, ABC37, CMD1O, FLJ36852  12:21831589-21990894 AS (12p12.1)  Predicted Maternal
Homo sapiens ABCG8 GBD4, STSL, MGC142217  2:43909606-43969108  (2p21)  Predicted Maternal
Homo sapiens ACD PIP1, PTOP, TPP1, TINT1  16:66238915-66262218 AS (16q22.1)  Predicted Maternal
Homo sapiens ADAMTS16 FLJ16731, ADAMTS16s  5:5183442-5383411  (5p15)  Predicted Maternal
Homo sapiens ALDH1L1 FTHFD, DKFZp781N0997  3:127295097-127392174 AS (3q21.2)  Predicted Maternal
Homo sapiens ANKRD11 T13, LZ16, ANCO-1  16:87851535-88094469 AS (16q24.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens APBA1 X11, X11A, MINT1, D9S411E, X11ALPHA  9:71225021-71487041 AS (9q13-q21.1)  Predicted Paternal
Homo sapiens B4GALNT4 FLJ25045, NGalNAc-T1, Beta4GalNAc-T4  11:349803-381791  (11p15.5)  Predicted Maternal
Homo sapiens BMP8B OP2, BMP8, MGC131757  1:39986489-40037119 AS (1p35-p32)  Predicted Paternal
Homo sapiens BRP44L CGI-129, dJ68L15.3  6:166688396-166726475 AS (6q27)  Predicted Paternal
Homo sapiens BRUNOL4 CELF4, BRUNOL-4  18:33067827-33409940 AS (18q12)  Predicted Maternal
Homo sapiens BTNL2 BTL-II, HSBLMHC1  6:32460490-32492877 AS (6p21.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens C10orf91 bA432J24.4, RP11-432J24.4  10:134098703-134121814  (10q26.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens C10orf93 bB137A17.3, RP13-137A17.3  10:134582680-134616053 AS (10q26.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens C16orf57 FLJ13154  16:56582805-56623022  (16q13)  Predicted Maternal
Homo sapiens C20orf20 Eaf7, MRGBP, URCC4, MRG15BP, FLJ10914  20:60888282-60912389  (20q13.33)  Predicted Maternal
Homo sapiens C20orf82 bA149I18.1, dJ1077I2.1  20:13140417-13239296  (20p12.1)  Predicted Paternal
Homo sapiens C6orf117 RP11-51G5.2  6:84790138-84867324  (6q14.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens C9orf116 FLJ13945, MGC29761, RP11-426A6.4  9:137516846-137541581 AS (9q34.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens C9orf85 MGC61599, RP11-346E17.2  9:73706242-73788192  (9q21.13)  Predicted Paternal
Homo sapiens CCBL2 KAT3, RBM1, RBMXL1, MGC9398, RP11-82K18.3, RP4-531M19.2, DKFZp547N1117, DKFZp667D0223  1:89164043-89241103 AS (1p22.2)  Predicted Maternal
Homo sapiens CCDC85A KIAA1912  2:56254761-56476812  (2p16.1)  Predicted Paternal
Homo sapiens CDH18 CDH14, CDH24, CDH14L, EY-CADHERIN  5:19498897-20027045 AS (5p15.2-p15.1)  Predicted Paternal
Homo sapiens CDK4 CMM3, PSK-J3, MGC14458  12:56418269-56442430 AS (12q14)  Predicted Maternal
Homo sapiens CHMP2A BC2, BC-2, VPS2, CHMP2, VPS2A  19:63744744-63768297 AS (19q)  Predicted Maternal
Homo sapiens CHST8 GalNAc4ST  19:38857273-38966253  (19q13.1)  Predicted Maternal
Homo sapiens COL9A3 IDD, MED, EDM3, FLJ90759, DJ885L7.4.1  20:60908858-60952955  (20q13.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens CSF2 GMCSF, MGC131935, MGC138897  5:131427383-131449757  (5q31.1)  Predicted Maternal
Homo sapiens CYP1B1 CP1B, GLC3A, P4501B1  2:38138249-38166795 AS (2p21)  Predicted Paternal
Homo sapiens DGCR6   22:17263778-17289600  (22q11.21)  Predicted Paternal
Homo sapiens DVL1 DVL, MGC54245  1:1250520-1284622 AS (1p36)  Predicted Maternal
Homo sapiens E2F7 FLJ12981  12:75929156-75993490 AS (12q21.2)  Predicted Maternal
Homo sapiens EGFL7 ZNEU1, MGC111117, VE-STATIN, RP11-251M1.2  9:138667197-138696950  (9q34.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens EVX1   7:27238688-27262716  (7p15-p14)  Predicted Paternal
Homo sapiens FAM132A C1QDC2, MGC105127  1:1157695-1181964 AS (1p36.33)  Predicted Maternal
Homo sapiens FAM50B X5L, D6S2654E  6:3784630-3806549  (6p25-pter)  Predicted Maternal
Homo sapiens FAM59A Gm944, C18orf11  18:28091460-28314444 AS (18q12.1)  Predicted Paternal
Homo sapiens FAM70B MGC20579, RP11-199F6.1  13:113589043-113661872 AS (13q34)  Predicted Maternal
Homo sapiens FASTK FAST  7:150394640-150418883 AS (7q35)  Predicted Maternal
Homo sapiens FERMT2 MIG2, KIND2, mig-2, UNC112, PLEKHC1, UNC112B, FLJ34213, FLJ44462  14:52383742-52497459 AS (14q22.2)  Predicted Paternal
Homo sapiens FGFRL1 FHFR, FGFR5  4:985609-1020685  (4p16)  Predicted Maternal
Homo sapiens FLJ20464 FLJ20464  22:30062750-30083443  (22q12.2)  Predicted Paternal
Homo sapiens FLJ40296 FLJ40296, MGC149404, MGC149405  13:56603052-56626073  (13q21.1)  Predicted Maternal
Homo sapiens FLJ46321 FLJ46321  9:83783506-83809985  (9q21.32)  Predicted Maternal
Homo sapiens FOXF1 FKHL5, FREAC1, MGC105125  16:85091633-85115570  (16q24)  Predicted Maternal
Homo sapiens FOXG1 BF1, BF2, QIN, FKH2, HBF2, HFK1, HFK2, HFK3, KHL2, FHKL3, FKHL1, FKHL2, FKHL3, FKHL4, HBF-1, HBF-2, HBF-3, FOXG1A, FOXG1B, FOXG1C, HBF-G2  14:28296037-28318621  (14q13)  Predicted Paternal
Homo sapiens FUCA1   1:24034153-24077407 AS (1p34)  Predicted Paternal
Homo sapiens GATA3 HDR, MGC2346, MGC5199, MGC5445  10:8126672-8167169  (10p15)  Predicted Paternal
Homo sapiens GFI1 ZNF163  1:92702908-92735020 AS (1p22)  Predicted Paternal
Homo sapiens GLI3 PHS, ACLS, GCPS, PAPA, PAPB, PAP-A, PAPA1, PPDIV  7:41957071-42253136 AS (7p13)  Predicted Maternal
Homo sapiens GPT AAT1, ALT1, GPT1  8:145690230-145713356  (8q24.3)  Predicted Maternal
Mus musculus Gnai3 Gnai-3, AI158965, AW537698  3:108225354-108284169 AS (3 48.8 cM)  Predicted Maternal
Homo sapiens HES1 HHL, HRY, HES-1, FLJ20408  3:195326627-195349089  (3q28-q29)  Predicted Paternal
Homo sapiens HIST3H2BB   1:226702430-226722881  (1q42.13)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXA11 HOX1, HOX1I  7:27177300-27201359 AS (7p15-p14)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXA2 HOX1K  7:27096497-27118918 AS (7p15-p14)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXA3 HOX1, HOX1E, MGC10155  7:27102333-27143163 AS (7p15-p14)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXA4 HOX1, HOX1D  7:27124650-27146923 AS (7p15-p14)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXA5 HOX1, HOX1C, HOX1.3, MGC9376  7:27137520-27159811 AS (7p15-p14)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXB2 K8, HOX2, HOX2H, Hox-2.8  17:43965015-43987391 AS (17q21-q22)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXB3 HOX2, HOX2G, Hox-2.7  17:43971230-44016808 AS (17q21.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXC4 HOX3, cp19, HOX3E  12:52686908-52746080  (12q13.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens HOXC9 HOX3, HOX3B  12:52670143-52693387  (12q13.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens HSPA6   1:159750659-159773310  (1q23)  Predicted Maternal
Homo sapiens IFITM1 9-27, CD225, IFI17, LEU13  11:293990-315271  (11p15.5)  Predicted Maternal
Homo sapiens KBTBD3 BKLHD3, FLJ30685  11:105417034-105463395 AS (11q22.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens KIAA1530 MGC117169  4:1321103-1381731  (4p16.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens KIAA1545 KIAA1545  12:131567229-131681847  (12q24.33)  Predicted Maternal
Homo sapiens LDB1 NLI, CLIM2  10:103847306-103874691 AS (10q24-q25)  Predicted Maternal
Homo sapiens LILRB4 HM18, ILT3, LIR5, CD85K, LIR-5, LILRB5  19:59855935-59881659  (19q13.4)  Predicted Maternal
Homo sapiens LMX1B NPS1, LMX1.2, MGC138325, MGC142051  9:128406618-128508550  (9q34)  Predicted Maternal
Homo sapiens LOC100131170 LOC100131170  17:76690599-76712249 AS (17q25.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens LOC51145 LOC51145  9:127536476-127558645 AS (9q33.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens LY6D E48  8:143853299-143875009 AS (8q24-qter)  Predicted Paternal
Homo sapiens MAGI2 AIP1, ARIP1, SSCAM, MAGI-2, ACVRIP1  7:77474309-78930825 AS (7q21)  Predicted Maternal
Homo sapiens MYEOV2   2:240704652-240734436 AS (2q37.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens MZF1 MZF-1, MZF1B, ZNF42, Zfp98, ZSCAN6  19:63755095-63786753 AS (19q13.2-q13.4)  Predicted Maternal
Homo sapiens NDUFA4P1 NDUFA4  1:107839142-107859771  (1p13.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens NKAIN3 FAM77D, FLJ39630  8:63314054-64076181  (8q12.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens NKX6-2 GTX, NKX6B, NKX6.2, MGC126684  10:134438309-134459526 AS (10q26)  Predicted Maternal
Mus musculus Ngfb   3:102263850-102334927  (3 48.5 cM)  Predicted Paternal
Homo sapiens OBSCN UNC89, FLJ14124, KIAA1556, KIAA1639, MGC120409, MGC120410, MGC120411, MGC120412, MGC138590, DKFZp666E245  1:226452483-226643197  (1q42.13)  Predicted Paternal
Homo sapiens OR11L1   1:246060852-246081820 AS (1q44)  Predicted Paternal
Homo sapiens OTX1 FLJ38361, MGC15736  2:63121468-63147817  (2p13)  Predicted Maternal
Homo sapiens PAOX PAO, MGC45464, DKFZp434J245, RP11-122K13.11  10:135032730-135065187  (10q26.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens PEX10 NALD, RNF69, MGC1998  1:2316100-2343869 AS (1p36.32)  Predicted Maternal
Homo sapiens PHPT1 PHP14, CGI-202, HSPC141, bA216L13.10, DKFZp564M173, RP11-216L13.10  9:138853366-138875310  (9q34.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens PKP3   11:374216-404907  (11p15)  Predicted Maternal
Homo sapiens PPAP2C LPP2, PAP-2c, PAP2-g  19:222042-252434 AS (19p13)  Predicted Maternal
Homo sapiens PRDM16 MEL1, PFM13, KIAA1675  1:2965603-3355044  (1p36.23-p33)  Predicted Paternal
Homo sapiens PTPN14 PEZ, PTP36, MGC126803  1:212587633-212801264 AS (1q32.2)  Predicted Maternal
Homo sapiens PURG PURG-A, PURG-B, MGC119274  8:30962862-31020772 AS (8p11)  Predicted Paternal
Homo sapiens PYY2   17:23567715-23589212  (17q11)  Predicted Paternal
Homo sapiens RAB1B   11:65782631-65811538  (11q12)  Predicted Maternal
Homo sapiens RBP5 CRBP3, CRBPIII, CRBP-III  12:7157553-7182732 AS (12p13.31)  Predicted Paternal
Homo sapiens RPL22 EAP, HBP15, HBP15/L22  1:6157666-6192265 AS (1p36.3-p36.2)  Predicted Paternal
Homo sapiens SALL1 TBS, HSAL1, ZNF794  16:49717386-49752683 AS (16q12.1)  Predicted Maternal
Homo sapiens SIM2 SIM, MGC119447  21:36983860-37054087  (21q22.2)  Predicted Paternal
Homo sapiens SLC26A10   12:56289959-56316200  (12q13)  Predicted Maternal
Homo sapiens SLC4A2 AE2, HKB3, BND3L, NBND3, EPB3L1  7:150377589-150414546  (7q35-q36)  Predicted Maternal
Homo sapiens SOX8 MGC24837  16:961808-986979  (16p13.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens SPON2 DIL1, DIL-1, Mindin, M-spondin  4:1140722-1166596 AS (4p16.3)  Predicted Paternal
Homo sapiens TIGD1 EEYORE  2:233111022-233133469 AS (2q37.1)  Predicted Paternal
Homo sapiens TMEM157 UNQ1912, MGC17345  5:99889022-99960338  (5q21.1)  Predicted Paternal
Homo sapiens TMEM52   1:1828889-1850566 AS (1p36.33)  Predicted Paternal
Homo sapiens TMEM60 DC32, C7orf35, MGC74482  7:77250980-77275682 AS (7q11.23)  Predicted Paternal
Homo sapiens TMEM88 FLJ20025, MGC71744  17:7689108-7710141  (17p13.1)  Predicted Maternal
Homo sapiens TSHZ3 TSH3, ZNF537, KIAA1474  19:36447690-36542029 AS (19q12)  Predicted Paternal
Homo sapiens VAX2 DRES93  2:70971227-71024083  (2p13)  Predicted Maternal
Homo sapiens VENTX NA88A, HPX42B, VENTX2, MGC119910, MGC119911  10:134891397-134915422  (10q26.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens WDR8 FLJ20430, MGC99569  1:3527198-3566496 AS (1p36.3)  Predicted Maternal
Homo sapiens ZFP36L2 BRF2, ERF2, ERF-2, TIS11D, RNF162C  2:43294209-43317248 AS (2p22.3-p21)  Predicted Maternal
Homo sapiens ZIC1 ZIC, ZNF201  3:148599870-148627195  (3q24)  Predicted Maternal
Homo sapiens ZNF225 MGC119735  19:49299387-49339094  (19q13.2)  Predicted Paternal
Homo sapiens ZNF229 FLJ34222  19:49612265-49654504 AS (19q13.31)  Predicted Maternal
Homo sapiens ZNF738   19:21323726-21370097  (19p12)  Predicted Paternal